Prema službenoj verziji, Hodorkovski je Putinu poslao molbu za pomilovanje zbog toga što mu je majka teško bolesna. S obzirom da takva molba automatski podrazumijeva priznavanje legitimnosti sudskih akata donesenih protiv njega, Hodorkovski ne samo da neće moći biti rehabilitiran u Rusiji već će očito i izgubiti borbu za imovinu Jukosa koju bi mogao pokrenuti u inozemstvu.
Otac Mihaila Hodorkovskog izjavio je u petak za Itar-Tass da se cijela obitelj veseli zbog izlaska sina iz zatvora te da ga čekaju u Moskvi. Njegova majka rekla je da je saznala za molbu sina za pomilovanje iz medija. Potvrdila je da su i ona i suprug bolesni.
Hodorkovski, nekad najbogatiji Rus, više puta je izjavio da neće tražiti pomilovanje od Putina jer bi to bilo jednako priznanju krivice. Pozivajući se na neimenovane izvore, Komersant je objavio da su predstavnici ruskih službi sigurnosti nedavno razgovarali s Hodorkovskim. Oni su mu tom prilikom rekli da se stanje njegove majke, koja boluje od raka, pogoršalo i upozorili ga da bi protiv njega mogla biti podignuta i treća optužnica.
Hodorkovski je 2005. osuđen na osam godina zatvora zbog utaje poreza i prijevare. Kazna mu je povećana na 14 godina zatvora u prosincu 2010., nakon drugog sudskog postupka u kojemu je osuđen za krađu nafte i pranje 23,5 milijardi dolara. Ta je kazna zatim smanjena za godinu dana, a nakon žalbe za još dvije. Hodorkovski je trebao izaći na slobodu u kolovozu 2014. Hodorkovski je nakon raspada SSSR-a osnovao naftnu tvrtku Jukos te preko nje stekao veliko bogatstvo. Razišao se s ruskim političkim vrhom i počeo podupirati i financirati oporbu.
